农民专业合作社存在的困难和问题：
目前，我国农民专业合作社已经发展到一个新阶段，新关口。这个关口需要农民专业合作社提升发展层次、规范组织行为。一方面是合作社必须注重经营，面对市场，强调竞争力、强调服务、强调带动，这就叫服务能力强，是经营方面的要求。另一方面是合作社毕竟不同于企业，它特别要强调民主管理好。
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1、支持多个社、多个网点同时进行操作，施行多网点间股金存取，完全支持区域性资金互助机构业务需求办理各项业务；
2、每个社可多个柜员同时操作，柜员数设置不受限制。
3、根据各地区的实际情况进行了大量的优化，资金互助社不需要购置昂贵的服务器、操作系统、数据库等软硬件设备，也无需聘用专业人员来进行系统维护、软件升级等 工作，仅需一台计算机和票据打印机等外设，以及一条上网线路即可，如此简便的配置即使在相对偏远地区也是很容易接入系统。
4、系统建立在客户信息基础上，其核心内容账务处理。并且总部和分支机构的系统分开，总部可以控制查看所有分支机构的所有业务信息。
5、系统界面美观，使用方便，操作人员易上手，通过对该系统的使用，使其业务流程信息化，规范业务操作流程，提高业务处理效率。
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