EM菌在种植的使用非常广泛，从美国，日本，德国等发达国家的种植农作物都已经推广普及，不仅可以种植果树，蔬菜，而且对于食用菌菇的效果也很好的。
EM菌在种植业上的使用方法和效果
一、em菌在种植业的使用效果：
1、增强植物新陈代谢，促进光合作用和强化叶片保护膜，抵抗病原菌，促时根系发达，使成期提前7 - 10天。
2、产生抗菌物质，抑制有害微生物繁殖，产生有益物质防治农作物各类病害。
3、有益菌群与土壤中放线菌等共生共殖，形成良好的作物生长环境，提高土壤肥质，彻底改良土壤性质，最终实现绿色有机农产品及免耕作业和可持续发展之路。
4、低成本、高回报，经多类作物使用效果显著。如瓜果类，单果增重、糖度增加、保果率增加35%-50%。
二、em菌在种植业使用方法：
1、发酵堆肥（制作基肥）
以杂草、人畜粪、秸秆（切碎）、锯木屑、谷糠、酒糟渣等混合料按：
1-3（EM生态菌）：150（井水）：500（混合料）比例发酵，先将生态菌加水搅拌匀后与混合料拌匀，堆集压实后用塑料薄膜或帆布密封发酵9-15天即可。具体发酵时间于冷比天热多几天，以发酵后产生酒曲香为准，发酵中发酵料高于45摄氏度后，可翻动降温后再密封继续发酵。发酵料密封后可保质100天。
2、叶面喷施
以1:500倍的稀释液雾状喷洒叶片正反面。
3、土壤改良
翻耕时，按每亩施发酵肥料400-600公斤，入土15公分以上，或在基肥中掺入EM生态菌，每亩使用量2公斤左右。
4、作物使用
瓜果类、豆类、果树、茶叶、药材、花卉、蔬菜等，在整地基肥后，育苗时须浸种后下播，出苗后喷1:500倍的稀释液一次，移植后再浇根一次，在作物生长一茬内至少喷洒3次以上。果木类作物在出芽后5天左右，每隔5-10天对枝叶喷洒一次，成熟期9月份后15天喷洒一次，可防病、防虫、提高产量品质。
注：作物生长期、果木壮果期可适当增加喷洒次数。建议：在傍晚无日当晒喷洒效果尤佳。
5、追肥料制作
以1生态菌：100粪水混合拌匀，盖上薄膜密封，2天拌动一次，7天后可作追肥使用。
6、菌菇生产
以1：600-1000倍的稀释液150斤掺入500斤菌料中拌匀后密封5-6小时，即可装袋接种，催菇促长则以1：100-250倍的稀释液参与喷施菇盖，菌菇可比常规生产增长45%。
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