综合保税区“保税一日游”要追溯到区外的加工贸易。加工贸易在促进我国经济发展上起到了重要作用，这在广东等东南沿海地区尤甚，如被誉为“制造之都”的东莞市，就与加工贸易发展密切相关。

在加工贸易深加工结转模式下，上游厂家成品即为下游厂家料件，通过深加工结转延长加工链条，成品最终加工完毕后出口至国外。以珠三角为例，经过几十年的培育发展，企业间配套协作密切，产业链契合度高，加工贸易企业之间货物来往频繁，但因为当时的贸易、税收和监管等政策配套不足及各地监管联动、手续复杂且人工作业效率低下等原因，深加工结转存在诸多不便，于是产生“香港一日游”：加工贸易企业先将加贸成品出口到中国香港，以核销手册、获取退税后，再以加工贸易方式申报进口，货物在保税状态下进入珠三角另外一家厂商进行下一道工序生产，但面临作业周期长、手续复杂、运力浪费等难题。

随着我国综合保税区、保税物流园区、保税物流中心（B型）等在全国落地开花，企业可以轻松利用特殊区域或保税物流中心（B型）开展“保税一日游”以代替“香港一日游”。