所有研究过ISO9001的人员，都能清楚认识到ISO9001对企业管理方面的帮助作用；
有效地运用ISO9001的确可以极大减少企业在内部控制方面的摸索及探究的过程；但当今仍有许多企业无法把ISO9001真正贯彻到日常工作中去，究其原因，有以下几大方面促成了这一状况的实现且愈演愈烈：
1.首先，由于企业管理层对ISO9001认识不足，导致无法为ISO9001运作提供必要的、协调促进的资源。
为能长期有效地运作ISO9001，企业应设置专职或相对专职的ISO工作人员（或者直接称其“管理者代表”），赋予其职责、权限，尤其应给予必要的“时间资源”；
但遗憾的是，许多企业虽有“管代”，但这些“管代”却难有充分的时间去实际从事ISO相关工作，而通常把该工作又交给其他的执行者，但这些执行者却未能予明确职责、权限等，容易造成把ISO当作一项任务来加以完成；久而久之，ISO9001会逐步演变成了一种被动的、主要是为了顺利通过“审核”而采取的动作，使ISO对企业的好处（或优点）无法体现。
2.相当部分的外部审核员由于工作经验等原因，无法引导企业逐步走向正确的ISO9001思维境界。
外部审核员如果仅是在审核过程中找出几个一般不符合，以判定企业体系是否有效的话，这种作业可能对企业的内审员来说将更为适合，而且可能还比外部审核员做的更好；
因此上述这样的作业不应该是外部审核员于现场审核时的首选；外部审核员在审核（尤其是监督审核时）应着重检查体系人员的ISO9001意识水准，以及企业是否确实能在日常作业的细微方面按部就班地运作了ISO9001，以使ISO的真实作用能够体现。
3.商业化的ISO9001内审员培训，造就了一批批仅能称之为掌握了ISO9001“应知应会”知识的人员，而非真正意义上的“内审员”。
当然，并不是所有的培训咨询机构都属于上述的这种类型；但现今太多的培训咨询机构的商业竞争，已无法使这一行业再变得“非商业”；虽然这样的培训结果对于企业来说存在实用效果方面的问题，但也只能接受（尽管有些不大公平），只好于日后通过自身的改造来加以提高。
总之，企业只有通过自身的努力，将ISO9001与日常工作相互熔合，才能真实地发挥出ISO9001的作用，达到“为我所用”，同时，这亦是ISO9001的实际用意。
换言之，亦只有在日常工作中将ISO9001充分发挥，方可确保企业的运作有条不紊，具备持续稳定的发展前景。
