一、物理方法：物理灭鼠主要是利用捕鼠器械如捕鼠夹、鼠笼、压板、铁刺、电子捕捉器等器械以及水淹法、扣捕法等进行灭鼠。

二、化学灭鼠：化学灭鼠是指使用有毒化合物杀灭鼠类的方法。化学灭鼠包括胃毒剂、熏杀剂、驱避剂和绝育剂等。化学灭鼠的优点是投放简单、工效高、灭效好、见效快，是目前大面积控制鼠害猖獗普遍使用的一种灭鼠方法。在化学灭鼠过程中主要使用抗凝血慢性杀鼠剂。抗凝血慢性杀鼠剂的优点主要有：一是安全。因慢性杀鼠剂作用缓慢，一般取食后3-4天才发病，人畜一旦误食中毒，抢救的余地大，并有特效解毒维生素K1。二是高效。由于慢性杀鼠剂作用慢，主要破坏抗凝血功能，造成大出血而死，这样老鼠死得很平稳，不会引起其它老鼠恐惧而拒食，从个体看老鼠死得慢些，但从整体看死得多一些，可获得较好的灭鼠效果。三是适口性好。这类鼠药毒力强，在毒饵中含量极低，不会影响老鼠的适口性。四是符合鼠的生态行为。五是成本低。抗凝血杀鼠剂在毒饵中含量小，成本低，农民易接受。目前主要品种有溴敌隆、大隆、杀鼠迷、杀鼠灵、敌鼠钠盐、氯鼠酮等。此类药剂对人畜安全，不易产生二次中毒，老鼠中毒时间慢，一般3天出现中毒症状，5-7天为死鼠高峰期。灭鼠效果十分显著。在化学灭鼠中严格执行国家明令禁止使用毒鼠强、氟乙酰胺、甘氟、氟乙酸钠和由这些原药加工的三步倒、闻到死、气死猫等剧毒鼠药。市场上任何没有“三证”的鼠药都不能用于灭鼠。

三、生物防治：利用自然界中某些生物来防治老鼠。控制鼠类的生物（即鼠类天敌）如鸟类、蛇、狗、猫等；也可以使用生物杀鼠剂肉毒梭菌毒素等防治老鼠。