微波医疗主要有三类不同应用：
1．理疗：
一般由外照式辐射器进行大面积的局部照射，有一定的渗透作用，局部人体吸收微波功率而产生微热效应，达到舒筋活血和消炎等目的，升温要求不严，一般为2—3℃，特点是体外治疗不需要脱衣。也可进行插入理疗，如肛门、阴道等。
2．肿瘤热疗：
国内外临床证明，肿瘤局部进行42—43℃的热疗并辅以放疗或化疗，由于特殊(非热)效应使疗效显著提高。热疗常用外照式或插入式辐射器，需控温。
3．组织凝固治疗：
一般用接触式或插入式辐射器,让微波能在很小的人体局部产生高温(≥100℃)可使出血部位外凝干化，息肉汽化，梗阻疏通及肿瘤坏死等，故广泛用于消化内科、皮肤科、妇科、肿瘤手术等。
微波的热效应作用：
生物体在微波场的作用下其带电粒子与极化分子剧烈运动而相互摩擦产生热效应。高能热效应使组织瞬间凝固，具有不炭化、无烟、无异味、损伤小、止血功能强等特点。
同时热效应使局部组织血管扩张，血循环加速，组织代谢增快，白细胞吞噬作用加强，促进局部病理代谢产物吸收，产生消炎、清肿作用。温热作用又可解除肌肉痉挛，清除堆积乳酸而使疼痛缓解。
微波的非热效应作用：
非热效应是微波照射治疗时，热量很小，小的使人不能察觉，产生生理和治疗作用。实际上组织局部会产生用精密测温仪器才能测到的升温现象。非热效应在消炎、消肿等方面都具有确切疗效。微波技术应用已经与多科学技术相接合，不断扩大应用范围。
治疗范围 :
妇产科：
宫颈糜烂、宫颈息肉尖锐湿疣、囊肿、带蒂粘膜下肌瘤、外阴赘生物、宫血、阴道炎、盆腔炎、小叶增生、切口感染、外阴白斑、瘙痒、输卵管炎引发不孕症、痛经、催乳等。
五官科：
鼻甲肥大、鼻息肉、鼻出血、慢性鼻炎、咽部滤泡增生、扁桃肿肥大、声带小结、慢性咽炎、耳道炎症、外耳道乳头状瘤、血管瘤、突发性耳聋、耳鸣、眼倒毛、打呼噜。
皮肤科 ：
各种血管瘤、寻常疣、扁平疣、尖锐湿疣、腋臭、溃疡皮炎、皮疹、疱疹、冻疮、脱毛。
理疗科：
肩周炎、关节炎、气管炎、胃肠炎、胆囊炎、盆腔炎、乳房包块、术后伤口愈合。腰扭挫伤及腰肌劳损、坐骨神经痛、感染等。
外科：
手术止血、无血肝脾切除、脑部手术、腹腔镜手术等。
消化科：
胃息肉、胃出血、食道炎、胃溃疡、结肠息肉、食道扩张、低位直肠息肉等。
呼吸内科：
肺支气管、肺叶积水(理疗)。
肛肠科：
内痔、外痔、混合痔、肛瘘、肛裂、内痔出血、肛门息肉、肛门湿疹、肛门瘙痒等。
泌尿科：
前列腺炎、前列腺肥肥大、膀胱炎、尿道息肉等 .
口腔科 :
牙根管消毒、海绵状血管瘤、苔藓 .
骨科 :
骨列、骨折 (在石膏或者夹板定位进行理疗).促进血液循环、镇痛、消炎、消肿
